ツクマテ

マップ上で起こる自動実行のイベントで
イベント1→スイッチをオンにして別マップでイベント2→最初のイベントの続き（イベント３）
という風にしているのですが、そのマップをいじってないにもかかわらず、はじめから通してそのマップにつくと
3から始まったり、2に移動してもまた1から始まったりと何故かうまく動きません。

http://pr3.work/0/ブレアド
元データと配布用データをお渡しいたしますので、原因がなにかわかれば幸いです。
問題の起こるマップはセーブデータ３の近くの塔の中（マップデータ9）です。

追記:別マップにあった２を１と繋げることで一本化し、不具合はなくなりましたが、
できればそれとは別に、今まで正常に動いていたのに何故不具合が起きたのかを知りたいです。

はじめから通してそのマップにつくと
3から始まったり、2に移動してもまた1から始まったりと何故かうまく動きません。

問題が起きるのははじめからプレイした場合のみ かつ 毎回再現するものでしょうか。
もしそうであれば、フラグ管理を失敗されているのだと思います。
移動用スイッチというスイッチを使い回されているようですので、その初期化漏れか何かじゃないでしょうか。

セーブデータは、プロジェクトデータの編集の影響を受けません。
つまり、途中までテストプレイしてセーブしたデータをAとします。
Aをセーブした後でゲームプロジェクトを編集し、はじめからプレイしてAと同じ地点までゲームを進行させたとして、その新しいデータはAとは違う状態になります。

古いセーブデータを使用したテストプレイで正常に動いているように見えても、実際にはじめからプレイするとバグっている、というケースは珍しくありません。

あるいは、採用されているプラグインがだいぶ古いようですので、その辺が悪さしている可能性もあります。
例えば、YEP_CoreEngineの最新版は1.32ですが、1.02を採用されているようです。