zipでの圧縮をした所、元データが何故か復活しました。
読み込みもできて、テストプレイ画面も開きました。
お手数お掛けして申し訳ありませんでした。
お陰で無事にデータが復活しました。
ありがとうございました。

RPGツクールMVで久しぶりに、ゲームデータを読み込もうと起動しましたが、system.jsonが読み込めないと出て、起動出来ませんでした。
game.rpgprojectを差し替えましたが治りませんでした。
dataを差し替えようとしましたが、1部エラーで差し替えが出来ませんでした。
出来なかったのは、マップ38、system.json、file1.save、global.save
そのまま起動すると、変数とスイッチが消えており、ゲームを起動すると、ファイルが見つかりませんでした、となり起動出来ませんでした。
バックアップしてなかったのが悪いのですが、手遅れでしょうか。