ツクマテ

この被ってるマップのレイヤーをイベントより上にしたいです。
なにをいじればいいでしょうか？

タイルセットの通行設定を★にすると良いと思います。
すでに★になっている場合は、イベントのプライオリティが「キャラの上」になっていないかを調べ
なっていたら「キャラと同じ」か「下」に変更する。

それ以外では、プラグインの影響かもしれない。