ツクマテ

作ったゲームのアップデートの際、アップデートの方法として新しく更新したゲームのsaveファイルに既存の今まで遊んでいたセーブデータを上書きするという方法を使っているのですが、それが原因なのか、他のものが原因なのかセーブデータを読み込もうとするとブザー音が鳴って読み込めません。どうすればいいでしょうか。

global.rpgsave ごとコピーしているかどうかを確認してみてください。
MVのゲームはセーブデータロード時に、 global.rpgsave の中にロード対象のセーブデータのメタ情報が含まれるかどうかを判定し、含まれていない場合は違うゲームのセーブデータとみなされてロードが失敗します。

global.rpgsave ごとコピーしてきても失敗するようであれば、別の原因がF12キーを押して表示されるDevToolsのConsoleタブに表示されるんじゃないかと思います。

セーブデータはフォルダごと上書きしているので問題ないと思います。
F12を押して出てくる「ErrorPrinter」以降の記述が原因となっているものなんでしょうか？

F12を押して出てくる「ErrorPrinter」以降の記述が原因となっているものなんでしょうか？

Consoleタブにエラーが出力されているのだとすれば、そこから原因を探ることができるかもしれません。
ファイルのロードそのものが失敗しているのか、あるいは中身のパースに失敗しているのかだと思われます。

RPGツクールMZ・MVでエラーが出た場合の質問方法に書かれている方法で、スタックトレースを確認してみてください。