自己解決しました。サイドビュー専用のフォルダがあることに気付かずそこにコピーしてませんでした。初歩的過ぎることですみませんでした。

公式にもある追加？エネミー（enemies1_1～enemies1_46）を使いたいんですがサイドビュー設定にすると画像選択から消失します。画像自体は消えているというよりサイドビューの時のみ無効になるようなんです。これって仕様ですか？またサイドビューで使用できるものとそうでないものの違いはなんですか？